民國八十年創設（碩士班）。

民國八十四年成立博士班。

邵廣昭 教授（80.8—83.7）

劉秀美 教授（83.8—86.7）

黃將修 教授（86.8—89.7）

程一駿 教授（89.8—92.7）

陳天任 教授（92.8—95.7）

張　正 教授（95.8－98.7）

陳義雄 教授（98.8－迄今）

本所成立之宗旨在積極從事海洋生物基礎研究，推動國內外學術研究合作以培育高級海洋生物人才，並提昇我國海洋生物研究之國際水準。由於台灣四面環海，海洋生物資源豐富，國人對海洋生物及漁業資源過去之利用與開發甚多，但卻缺乏基礎之調查、研究規劃及適當之保育及管理，以致有物種趨於絕滅及資源面臨枯竭之危機。因此積極培育更多基礎海洋生物之高級研究人才來投入海洋生物分類、生態、生活史、演化、資源狀況、與保育等各方面之研究，才能使目前國內海洋生物及海洋生態環境得以振衰起蔽。

1. 有效訓練培育高級研究人才。

2. 加強基礎研究提昇我國海洋科學學術地位。

3. 重視理論與實際應用之結合，以協助政府利用與保育海洋生物資源。

4. 支援本校生命與資源科學院或理工學院各系所之生物教學及推動跨系所之合作研究。

1. 海洋生物之基礎生物學，含行為、生理、生化、生活史等。

2. 海洋生物系統分類、地理分佈。

3. 海洋生物之生態與進化。

4. 海洋生物資源之保育。

5. 海洋生物之應用與環保科技。 

1. 紮實的基礎知識建立：藉由核心必修課程的教學，奠定良好的專業基石。

2. 厚實的專業領域課程訓練：五個專業學門進階課程，有效訓練成為海洋生物研究之專才。

3. 重視理論與實務的結合：規劃有實習課程及海上實習，以培養務實之海洋科學研究專才。

4. 落實研究及實驗能力的訓練：從實習實驗課程及執行研究計劃中，提升學生之技術實作能力。

5. 訓練學生具有獨立收集資料、分析、組織結論及表達之能力：藉由專題討論、實驗室研討會議、論文計劃書審查、博士候選人資格考核之GRE制度、研究成果展及口試等方式來訓練。

6. 提供更多論文研究的領域：與中研院合聘師資及推行跨系所之教學合作。

7. 讓學生更多瞭解海洋生物研究之發展趨勢及新知：廣泛邀請國內外學者專家蒞校發表學術演講。

8. 提升學生英文與國際化能力：「專題討論」鼓勵學生以英文報告，並開設有全英文授課課程，以及薦推送學生參與國際研討會議。

9. 掌握海洋科學發展的趨勢與社會脈動：教師不斷地吸收新知，並隨時修訂教學內容與開設相關課程。

10. 透過上述教學與學習法，以培育通曉原理與技術，並能獨立作業之人才。

1. 重視海洋生物之基礎生物學，每位學生應對海洋生物有綜合性的認識與概念，本所之必修課程有專題討論、海洋生物學特論、海洋生態學及海洋生物調查技術，使學生對基礎理論及技術有了一般性的認知後，再進一步學習各實驗室的專門領域，期能符合教學目標與特色。

2. 於海洋微生物、浮游植物、浮游動物、海洋真菌等微細海洋生物方面有開設有很多之專業課程究，不使學生僅侷限於中大型海洋生物之學習。

3.  開設有魚類及甲殼類生態、演化與系統分類之相關課程，使學生對海洋中最常見的一群生物有深入的瞭解。

4. 海洋環境保護為全球重要課題，本所設有海洋生物資源之保育課程，討論海洋生物資源之永續利用經營的原則及方式，以了解如何達到資源保育的目的。

5. 海生所設有環境復育課程，利用微生物淨化污染達到復育環境的目的。

6. 海生所設有電子顯微鏡中心，開設有初、中、進階的電子顯微鏡認識及應用課程，訓練學生具應用電子顯微鏡技術之技能。

7. 課程設計重視理論與實際應用之結合，使學生未來在工作上得以學以致用。

1. 單細胞藻類在海洋生態系中的地位、東海浮游植物之長期觀測與研究。

2. 浮游動物與珊瑚礁生物之環境影響評估、雷射光學科技在海洋生物上之應用、橈足類攝食生態研究、海洋橈足類行為研究。

3. 蝦蟹之鑑定、資源評估及保育研究、甲殼類多樣性的調查研究。

4. 分解海洋污染物或油污微生物之研究、海洋環境與污染物對海洋環境之影響、微生物生態、酵素化學。

5. 海洋資源評估及保育、河口及溼地之生態和保育、海龜生物學、附著生物之防治。

6. 溪流及河口生態之研究、魚類系統分類及生態調查研究，魚類之動物地理分布研究、世界新種的發現及DNA分子地理親緣演化研究。

7. 海藻系統分類及演化。

8. 甲殼類病毒學研究。

9. 海洋真菌之研究。

　　本所有專任教師10名、合聘教師2名，教師們的專長涵蓋海洋生物之病毒、微生物、浮游植物、浮游動物、海洋真菌、海洋無脊椎動物、海藻、魚類及底棲生態等各領域，同時亦各兼具生理、行為、生化、分子生物、統計、遺傳、電腦、環境、海洋、教育等不同學門的專長，不但可傳授學生完整之海洋生物知識，同時亦可以團隊合作方式進行整體之海域生物或生態、資源等之調查、研究與評估工作。海洋生物種類甚多，國內在分類與生態方面基礎研究之專門人才不足，故本所未來將持續以分類與生態為本所研究與發展之特色，以支援國內各項與海洋生物相關之漁業、工業、醫藥、教育、環保、經建等相關之研究發展與資源之開發利用。

　　將秉持現有的基礎，持續進行分類與生態方面的研究，將研究區域由國內擴展至其他地區、期以全球性的角度來審視我們所關心的問題，除了獨立進行研究外，並尋求國際合作的機會，積極與國內外各相關學校或研究機構有更密切的合作，建立更多的合作性研究，以提昇我國海洋科學學術地位。

　　將爭取更多的教授員額及人力資源來從事研究及教學工作，並重視理論與實際應用之結合，協助政府利用與保育海洋生物資源；同時擬設置海洋生物專業諮詢機構，以提供學術界及業界相關資訊。

　　持續積極培育基礎海洋生物之高水準研究、教學與管理人才，以投入海洋生物分類、生態、生活史、演化、資源狀況與保育等各方面之研究，並鼓勵師生能多多參與國內外學術活動及發表研究成果於國際性的著名學術期刊雜誌，藉以推動本所成為國際公認的著名研究所為目標。

主要進修領域

　1.海洋生物研究所

　2.生物相關研究所

　

就業管道

　1.政府機構或研究機構

　2.學校教師

　3.生物環保相關私人企業